并称为“天下霸道三剑”的天生牙、丛云牙和铁碎牙分管天、地、人三界，当年全部为犬夜叉的父亲斗牙王所拥有。斗牙王与人类公主十六夜相恋，生下犬夜叉，此举惹来暗恋十六夜的武将刹那猛丸的嫉妒。身负重伤的斗牙王用天生牙救活被猛丸杀死…

邪恶的奈落与犬夜叉一行的战争愈演愈烈，为了保护心脏不受伤害，他在白灵山分离出一个能洞察人类心灵的婴儿，并将心脏托其保管。在此之后，婴儿被某高僧砍作两半，变成白童子和赤子。当得知奈落心脏的重要性时，这两个同样邪恶的童子决定…

日暮戈薇是就读于国中三年级的15岁普通小女生，某日，她偶然通过家中神社的枯井来到了500年前的战国时代。时狼烟四起，妖怪横行，世间大地生灵涂炭。戈薇在御神木那里邂逅了被封印的半妖犬夜叉。50年前，意欲变成真正妖怪的犬夜叉，为了…

与宿敌·奈落的最终决战！！ 50年前，设下圈套让犬夜叉和桔梗互相憎恨的因缘之敌·奈落。在那一战后，犬夜叉被封印，桔梗也因为重伤而死去……同样是因为奈落的诅咒，弥勒的祖父的右手被打开了风穴，随时都会有可能被吸入并代代相传；珊…

元军攻打日本之际，中国大陆的妖怪为了得到死者魂魄亦东渡日本。在这里，他们遭遇了犬夜叉的父亲斗牙王。经过一番艰苦鏖战，大陆妖怪最终被封印在斗牙王的牙齿中。时间回到战国时代，四魂之玉的一枚碎片飞到不归之森，唤醒了大陆妖怪首领…

在某个朔夜，犬夜叉一行和妖怪奈落展开最终决战。经过一番艰苦缠斗，他们终于消灭这个邪恶的妖怪，漫长的征战终于告一段落。戈薇短暂回到现代休整，随后再次和犬夜叉、七宝踏上寻找四魂玉碎片的旅程；法师弥勒的风穴消失，他返回寺庙拜祭…

犬夜叉、戈薇、弥勒、珊瑚、琥珀众人随杀生丸等同行。杀生丸原本就对父亲将铁碎牙传给犬夜叉耿耿于怀，当领悟到父亲有意令冥道残月破融进铁碎牙时心中更是充满怨恨。正值此时，神无的白夜出现，将镜妖的碎片留下。杀生丸把碎片融入天生牙…

正在读初中三年级的女生——日暮戈薇是一名家住在神社的普通女孩子。15岁生日那天，被妖怪──百足妖妇拖入神社的枯井中，来到了500年前的日本战国时代，并与已被封印的半妖——犬夜叉相遇。犬夜叉自称是为得到四魂之玉以成为真正的妖怪…